研究概况

长期从事光学显微成像及其生物医学应用的研究，在生物医学成像、传感及智能病理等领域的方法创新、系统设计和集成等方面取得了一些重要研究成果，例如设计研制了（1）实时、高分辨、超大尺度显微成像系统及随机扫描宽视场层析显微成像系统，实现了厘米级视场、亚细胞级分辨率的高速、高通量成像，并成功应用于小鼠神经网络活动的在体观测；（2）三维高速双光子荧光显微成像系统，用于小动物在体神经回路成像；（3）自适应光学显微系统，用于在体深层生物组织成像；（4）新型相干拉曼显微系统及其所需超短脉冲激光光源等，用于化学特异性、无标记成像。

在光学工程、生物光子学领域，以第一作者或通讯作者已发表 SCI 收录论文60余篇（包括 Nature Photonics论文2篇、Nature Methods论文 2 篇、Nature Machine Intelligence论文1篇、Science Advances论文1篇）。曾在 SPIE Photonics West、LALS等国际会议多次做特邀报告。

主持承担国家自然科学基金重点项目、科技创新2030——“脑科学与类脑研究”重大项目（青年科学家项目）等，参与国家自然科学基金创新群体项目等，曾入选国家海外高层次人才引进计划（青年项目）等，获《麻省理工科技评论》中国区“35岁以下科技创新35人”等荣誉。

本课题组将继续围绕新型光学显微成像、传感及其生物医学（尤其是脑科学、免疫科学、临床医学）应用开展研究，探索生物光子学的新理论、新方法、新技术，并致力于生物医学科学仪器研究，推动所研发技术的生物医学应用。

将基础理论与上述研究进展结合，本课题组开设《神经光子学》课程，现已发布到学堂在线（https://www.xuetangx.com/ ），供大家交流。

代表性论文如下：

1. Ruheng Shi*, Xinyue Chen*, Junhao Deng*, Junhao Liang, Kuikui Fan, Feifan Zhou, Peifu Tang†, Licheng Zhang† & Lingjie Kong†, Random-access wide-field mesoscopy for centimetre-scale imaging of biodynamics with subcellular resolution, Nature Photonics (2024), https://www.nature.com/articles/s41566-024-01422-1

Nature Photonics 18, 721–730 (2024) (*第一作者，†通讯作者)

2. Junhao Liang, Weisheng Zhang, Jianghui Yang, Meilong Wu, Qionghai Dai†,, Hongfang Yin†,, Ying Xiao†, & Lingjie Kong†, Deep learning supported discovery of biomarkers for clinical prognosis of liver cancer, Nature Machine Intelligence 2023, https://doi.org/10.1038/s42256-023-00635-3 (†通讯作者)

3. Bingqian Zhou*, Kuikui Fan*, Jingjing Guo*, Jiesi Feng, Changxi Yang, Yulong Li, Songhai Shi, and Lingjie Kong, Plug-and-play fibre-optic sensors based on engineered cells for neurochemical monitoring at high specificity in freely moving animals, Science Advances 9(22), eadg0218 (2023) https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adg0218 (*第一作者)

4. Jingtao Fan*, Jinli Suo*, Jiamin Wu*, Hao Xie*, Yibing Shen, Feng Chen, Guijin Wang, Liangcai Cao, Guofan Jin, Quansheng He, Tianfu Li, Guoming Luan, Lingjie Kong†, Zhenrong Zheng† & Qionghai Dai†, Video-rate imaging of biological dynamics at centimeter scale and sub-micron resolution, Nature Photonics 13, 809–816 (2019) (*第一作者，†通讯作者)

5. Jung-Hoon Park*, Lingjie Kong*, Yifeng Zhou and Meng Cui，Large-field-of-view imaging by multi-pupil adaptive optics, Nature Methods 14,581–583 (2017) (*第一作者)

6. Lingjie Kong, Jianyong Tang, Justin P. Little, Yang Yu, Tim Lämmermann, Charles P. Lin, Ronald N. Germain and Meng Cui, "Continuous volumetric imaging via an optical phase-locked ultrasound lens, " Nature Methods 12, 759–762 (2015)